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【深圳商報(bào)訊】（記者張妍通訊員田嬌）8月16日，“數(shù)源杯”百萬(wàn)單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)算法大賽在深圳國(guó)家基因庫(kù)舉行決賽，來(lái)自國(guó)內(nèi)外10所高校的10組精英團(tuán)隊(duì)在此展開(kāi)一場(chǎng)關(guān)于“BT+IT”的較量。
據(jù)了解，該賽事由深圳國(guó)家基因庫(kù)主辦，深圳華大生命科學(xué)研究院、深圳市猛犸公益基金會(huì)、深圳市華大基因?qū)W院協(xié)辦，旨在提升單細(xì)胞聚類算法的性能。
深圳國(guó)家基因庫(kù)主任王韌表示，從2009年第1篇單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文章橫空出世至今，短短10余年間單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)在生命科學(xué)研究各層面都獲得了快速、廣泛的應(yīng)用，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展也日新月異。“隨著單細(xì)胞數(shù)據(jù)的不斷產(chǎn)出，數(shù)據(jù)處理的通量不斷攀升，這意味著單細(xì)胞計(jì)算工具的性能也需要不斷提升，方能滿足該領(lǐng)域飛速發(fā)展的需求。”
深圳國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)負(fù)責(zé)人魏曉鋒表示，深圳國(guó)家基因庫(kù)本身就是以生命大數(shù)據(jù)和大樣本存儲(chǔ)為根基的國(guó)家基因庫(kù)，希望以舉辦該賽事為契機(jī)，讓更多領(lǐng)域的科研人員更好地利用相關(guān)資源，更好地挖掘相關(guān)信息。該賽事吸引了全球300余支隊(duì)伍報(bào)名參與，累計(jì)提交作品達(dá)1819件次，最終經(jīng)過(guò)初賽、復(fù)賽的嚴(yán)格評(píng)審篩選，10支隊(duì)伍入圍決賽。
“我們最終目的是希望推動(dòng)應(yīng)用，比如精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)育種等。”魏曉鋒表示，該賽事產(chǎn)生的算法工具將部署到生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)上，免費(fèi)提供給醫(yī)療機(jī)構(gòu)和科研機(jī)構(gòu)人員使用。
BT指的是生物技術(shù)，IT則是信息技術(shù)，“BT+IT”的融合則可能是下一個(gè)產(chǎn)業(yè)的爆發(fā)點(diǎn)。華大集團(tuán)首席科學(xué)家、華大生命科學(xué)研究院院長(zhǎng)徐訊在賽事發(fā)言中透露，科技部的“十四五”重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃上已啟動(dòng)了“BT+IT”融合項(xiàng)目。
徐訊認(rèn)為，“BT+IT”融合包括兩方面內(nèi)容，一是利用生物技術(shù)來(lái)突破信息技術(shù)的局限。目前，沒(méi)有任何一種存儲(chǔ)介質(zhì)可以像DNA一樣把信息儲(chǔ)存上百萬(wàn)年的時(shí)間，如果用AGCT4種堿基字符作為編碼來(lái)取代計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)格式，存儲(chǔ)年限將遠(yuǎn)超過(guò)目前的磁介質(zhì)和光介質(zhì)。二是利用信息技術(shù)解決生物技術(shù)的問(wèn)題，“這就是今天比賽的內(nèi)容之一，而這僅僅是一個(gè)開(kāi)端。”